Управление и организацию научной, инновационной, международной деятельностью и дополнительным образованием института осуществляет начальник отдела по науке, международным связям и дополнительному образованию (НМСиДО).

Ученый Совет института регулярно рассматривает вопросы, связанные с научной и инновационной деятельностью.

Отдел по НМСиДО разрабатывает концепцию научно-исследовательской и инновационной деятельности, которая затем утверждается Ученым Советом.

Планирование научно-исследовательской работы (НИР) ведется в рамках основных научных направлений института. Ежегодно формируются планы по следующим направлениям:

• НИР по федеральным научно-техническим и целевым программам;
• НИР по заданию и программам Министерства науки и образования России;
• НИР по грантам;
• НИР в рамках международного сотрудничества;
• НИР по хоздоговорам;

Научно-исследовательские работы выполняются научно-педагогическими работниками института, в рамках научных направлений кафедр. Научные направления кафедр полностью соответствуют профилю подготовки.

Учеными и преподавателями института ведется большая работа по рецензированию внешних научных трудов.

В 2009 году с целью активизации научной работы создано 4 малых инновационных предприятия (МИП) в форме обществ с ограниченной ответственностью в соответствии с Гражданским кодексом Российской Федерации, Федеральным законом от 08.02.1998 №14-ФЗ «Об обществах с ограниченной ответственностью» и иным действующим законодательством РФ. На данный момент осуществляет научную деятельность МИП - ООО «ХТИ-Энергоаудит».

В настоящее время в институте ведутся научные исследования по следующим направлениям:

• Эксплуатационная надёжность. Энергосбережение. Оперативное управление процессами технического обслуживания гидрофицированных машин и оборудования. Исследование электромагнитной совместимости и качества электроэнергии в системах электроснабжения; Оптимизация, электромеханических систем экскаваторов;
• Совершенствование интеллектуально - информационных систем применительно к задачам техники и экономики;
• Региональная и муниципальная экономика;
• Исследование влияния технологических факторов на получение отливок с дифференциальными свойствами;
• Разработка строительных материалов и технологий на основе местного сырья и отходов производства Республики Хакасия;
• Повышение огнестойкости и пожарной безопасности утеплителей и лёгких ограждающих конструкций.

Институт имеет договорные отношения с предприятиями Хакасии: ОАО «Абаканский опытно-механический завод», ОАО «Черногорскпромстрой», ООО «Энергия», МУ «Архоград», ООО «Пассажирское автотранспортное предприятие», ООО УКС «Жилстрой», ООО «Тигробент», ЗАО «Черногорский Искож-Регенерат», ООО «Триада Холд», ООО КСК «Людвиг», ООО «Ремстрой», ООО «ТрансГрупп», ООО «НВФ-строй», ООО «Локко», ООО «Экспертиза недвижимости», ООО «Сибирская генерирующая компания», ООО «СУЭК-ХАКАСИЯ»», ООО «Боградский ГОК».